綜上所述，咖啡的負面作用很多，因此能戒除最好。不過，戒除咖啡的難度不輸給戒煙，很多突然戒咖啡的人，都會覺得精力不繼、疲倦不堪，更糟糕的是產生頭痛癥狀及暴躁、抑郁現象，這是因為他們已經對咖啡因上癮了。有些人受不了，便“大開殺戒”痛飲，結果一下子喝太多，反而導致血壓下降，出現相當危險的心悸現象。
因此，要想戒除咖啡，絕對不要操之過急，最好能逐漸減少飲用量，并改喝咖啡因含量比較低的咖啡。在所有咖啡中，蒸憾式咖啡所含的咖啡因最高，即溶咖啡最低。只要將咖啡因攝取量控制在安全界線內，即使不能完全戒除也不會有太大的影響。
此外，用過濾器濾過的美式咖啡，比起只煮而不過濾的歐式咖啡，較不容易增加膽固醇。這是因為咖啡中含有一種“脂類因子”，會增加人體內的膽固醇，而這種成分比較不容易穿透過濾器。因此，即使你喝的是即溶咖啡，也最好先用濾紙過濾后再飲用。
有些人并不想減少咖啡的飲用量，他們或許會說，市面上不是有“去咖啡因”的咖啡，喝那個不就沒事了嗎？很抱歉，這些咖啡仍然殘存著微量的咖啡因（一杯含三四毫克）；而且還是含有“脂類因子”，這種成分加上去咖啡因的不明彳匕學物質，不但不會讓你體內的膽固醇減少，反而還會使其上升。而且，美國加州的研究人員也發現，這種咖啡會造成某一種脂蛋白指數上升，而這種脂蛋白正是誘發心臟病的危險因子。據科學家估計，改喝不含咖啡因的咖啡，反而可能會增加10%罹患冠狀動脈疾病的概率，中風的概率更高。
更可怕的是，許多廠商用來去除咖啡因的化學藥劑，如氯化鉀基、乙基乙烯、二氯甲烯等，在動物實驗中都有致癌的可能。即使已有少數廠商致力研究其他去除咖啡因的方法（例如雀巢采用“純凈水式”去除咖啡因），但絕大多數采用傳統做法的廠商依然會以“商業機密”為由，不讓消費者有知情的權利。因此，如果大量飲用經過這種做法處理過的咖啡，還為了已減少攝取咖啡因而沾沾自喜，可是不太聰明！