使用有機肥的優點：
第一，營養全面。100千克的干豬糞，含有氮（N）5?4千克，磷（P2O5）4.0千克，鉀（&O）4?4千克。這些養分相當于硫酸錢27.0千克，過磷酸鈣24.0千克，硫酸鉀&8千克。另外還有少量的鈣鎂硫及各種微量元素。各種秸稈燃燒后的灰分，稱為草木灰，含鉀（瓦0）特別豐富，高達8.1%,還有2.3%的磷（P2O5）和10.7%的鈣（CaO）。即100千克草木灰，相當于硫酸鉀16?3千克，過磷酸鈣13?8千克。
第二，提高水體養分的有效性。有機肥以有機質為主，施入水體后，水體中和池塘底質中的有機質必然會增加。因此在池塘這個小生境中，土壤微生物也就變得非常活躍，它們在分解水體中和土壤中的有機質時，一方面釋放出生物餌料所需的各種養分，另一方面微生物所分泌的有機酸，又能促進土壤中一些難溶礦物質的溶解，達到提高水體養分有效性的效果。
第三，能改良水體成分。有機肥施入水體后，各種有效的營養成分也就隨之被水體所接受，部分有機物質可以絡合水體中有毒或難溶解的無機鹽而沉積于淤泥中，緩解了水體的毒素影響，改良了水體的營養成分。
第四，促進底質結構的改良。微生物在分解有機質的過程中，一方面提供養分給作物，另一方面又形成一種黏結性物質，把分散的土粒團聚在一起，形成一種疏松的團粒結構。這種結構對提高池塘底質的保水、保肥、保溫能力起重要作用。
第五，可以變廢為寶，凈化環境。制作有機肥的材料來源很廣，成本也很低，生產潛力很大，如人糞尿、畜禽糞便、各種作物的秸稈、塘境地頭的雜草、水產品加工后的殘渣以及城市垃圾等。這些廢、雜物，如果不用來制成有機肥，就會污染人類的生活環境，所以說，施用有機肥實際上是變廢為寶，也是對環境的凈化。